生物表面活性剂促进有机污染物降解的作用机理、其与降解菌株及底物的相互作用关系都还不甚清楚。虽然生物表面活性剂促进了微生物降解，但它们也有一些抑制因素，如有些表面活性剂浓度达到CMC以上时就对微生物有毒性，有些生物表面活性剂的胶粒能干扰细胞过程。生物表面活性剂也能作为一种优先碳源，与有机污染物的降解形成竞争，从而导致污染物降解率下降。此外表面活性剂还可能造成微生物数量的分散而导致不同的结果。这些作用机理都需要深入探究。?

生物表面活性剂的使用会对生活于其中的土著微生物种群产生一定的毒性和影响，此外由于其能被微生物降解，其代谢产物可能更具毒性。因此，生物表面活性剂的存在可能会会对环境造成一定的污染并增加了环境污染的负担。可见，加强生物表面活性剂对环境产生潜在的影响和其生物降解特性的研究，将为有效地控制生物表面活性剂造成的环境污染、合理利用生物表面活性剂，提供重要的科学依据。在进行现场表面活性剂增溶修复时，必须进行全面的生物表面活性剂毒性和环境危害性实验，确保生物表面活性剂使用安全。

表面活性剂胶团的加溶作用在洗涤过程中可能有重要的影响，也有不少事实与此论述不符。但无论如何，表面活性剂的乳化作用，不管油污多少，在洗涤过程红棕总是相当重要的。要使乳化作用顺利进行，必须加入有高表面活性的表面活性剂，以大限度地降低界面张力。这样，只需用小的机械功（略做搅拌）即可乳化。在降低界面张力的同时，界面吸附伴随发生，形成有一定强度的界面膜，防止油珠聚结，有利于乳状液的稳定，油污质点也一步再沉积于固体表面，然而很明显，仅仅是油污的乳化、分散，尚不足以有效地完成洗涤过程，还需要根据具体情况，考虑前面讨论过的各种因素的影响。

表面活性剂在污垢及洗涤物品表面上（自溶液中）的吸附，对洗涤作用有重要影响。这一影响主要是由于吸附使得界面及表面在各种性质（如机械性质、电性质及化学性质）上均有变化而产生的。

对于液体油污，表面活性剂在油/水界面上的吸附主要导致界面张力降低，从而有利于油污的清洗。界面张力的降低，也有利于形成分散度较大的乳状液，同时由于界面吸附所形成的界面膜一般具有较大的强度，而且吸附膜可能带电（若是吸附表面活性离子），于是使形成的乳状液具有较高的稳定性，不易沉积于洗涤物表面。